Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNCAP37840 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAP37840 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNCAP37840 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNCAP37840 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNCAP37840 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNCAP37840 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNCAP37840 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNCAP37840 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNCAP37840 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNCAP37840 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNCAP37840 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCAP37840 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCAP37840 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAP37840 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNCAP37840 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNCAP37840 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNCAP37840 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNCAP37840 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNCAP37840 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCAP37840 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNCAP37840 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNCAP37840 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNCAP37840 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNCAP37840 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNCAP37840 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNCAP37840 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNCAP37840 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNCAP37840 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNCAP37840 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNCAP37840 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCAP37840 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCAP37840 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNCAP37840 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNCAP37840 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNCAP37840 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCAP37840 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNCAP37840 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCAP37840 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNCAP37840 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNCAP37840 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNCAP37840 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNCAP37840 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNCAP37840 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNCAP37840 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCAP37840 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCAP37840 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNCAP37840 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNCAP37840 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNCAP37840 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNCAP37840 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNCAP37840 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNCAP37840 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNCAP37840 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNCAP37840 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNCAP37840 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCAP37840 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNCAP37840 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNCAP37840 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNCAP37840 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNCAP37840 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNCAP37840 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNCAP37840 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNCAP37840 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNCAP37840 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNCAP37840 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNCAP37840 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNCAP37840 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNCAP37840 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNCAP37840 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCAP37840 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNCAP37840 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNCAP37840 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNCAP37840 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNCAP37840 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNCAP37840 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNCAP37840 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCAP37840 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCAP37840 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCAP37840 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCAP37840 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCAP37840 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCAP37840 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCAP37840 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCAP37840 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCAP37840 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNCAP37840 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCAP37840 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCAP37840 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCAP37840 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCAP37840 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCAP37840 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNCAP37840 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCAP37840 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCAP37840 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCAP37840 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCAP37840 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCAP37840 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCAP37840 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCAP37840 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms