Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINF1P36955 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERPINF1P36955 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINF1P36955 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINF1P36955 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINF1P36955 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINF1P36955 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINF1P36955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINF1P36955 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINF1P36955 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINF1P36955 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINF1P36955 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINF1P36955 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINF1P36955 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINF1P36955 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINF1P36955 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINF1P36955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINF1P36955 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINF1P36955 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINF1P36955 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINF1P36955 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINF1P36955 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINF1P36955 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINF1P36955 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPINF1P36955 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms