Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGA1P29973 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNGA1P29973 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNGA1P29973 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNGA1P29973 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CNGA1P29973 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGA1P29973 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGA1P29973 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGA1P29973 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGA1P29973 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGA1P29973 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGA1P29973 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGA1P29973 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNGA1P29973 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGA1P29973 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNGA1P29973 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNGA1P29973 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNGA1P29973 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNGA1P29973 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNGA1P29973 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CNGA1P29973 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNGA1P29973 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGA1P29973 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNGA1P29973 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CNGA1P29973 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CNGA1P29973 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CNGA1P29973 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CNGA1P29973 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGA1P29973 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGA1P29973 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGA1P29973 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CNGA1P29973 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CNGA1P29973 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CNGA1P29973 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNGA1P29973 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNGA1P29973 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGA1P29973 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGA1P29973 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CNGA1P29973 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CNGA1P29973 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGA1P29973 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CNGA1P29973 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNGA1P29973 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGA1P29973 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CNGA1P29973 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNGA1P29973 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGA1P29973 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGA1P29973 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGA1P29973 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGA1P29973 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGA1P29973 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGA1P29973 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGA1P29973 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNGA1P29973 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGA1P29973 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGA1P29973 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGA1P29973 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNGA1P29973 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNGA1P29973 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms