Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCNE1P24864 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCNE1P24864 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCNE1P24864 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCNE1P24864 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCNE1P24864 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCNE1P24864 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCNE1P24864 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCNE1P24864 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCNE1P24864 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCNE1P24864 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCNE1P24864 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCNE1P24864 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCNE1P24864 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCNE1P24864 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCNE1P24864 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCNE1P24864 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCNE1P24864 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCNE1P24864 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCNE1P24864 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCNE1P24864 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCNE1P24864 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCNE1P24864 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCNE1P24864 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCNE1P24864 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCNE1P24864 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCNE1P24864 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CCNE1P24864 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCNE1P24864 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCNE1P24864 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCNE1P24864 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCNE1P24864 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCNE1P24864 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCNE1P24864 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms