Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TGM1P22735 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TGM1P22735 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TGM1P22735 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TGM1P22735 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGM1P22735 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TGM1P22735 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TGM1P22735 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TGM1P22735 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TGM1P22735 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TGM1P22735 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TGM1P22735 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TGM1P22735 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TGM1P22735 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TGM1P22735 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGM1P22735 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TGM1P22735 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TGM1P22735 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TGM1P22735 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TGM1P22735 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TGM1P22735 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TGM1P22735 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TGM1P22735 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TGM1P22735 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TGM1P22735 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TGM1P22735 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TGM1P22735 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TGM1P22735 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TGM1P22735 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TGM1P22735 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TGM1P22735 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TGM1P22735 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGM1P22735 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGM1P22735 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TGM1P22735 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TGM1P22735 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TGM1P22735 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGM1P22735 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TGM1P22735 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TGM1P22735 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGM1P22735 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGM1P22735 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGM1P22735 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGM1P22735 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM1P22735 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TGM1P22735 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGM1P22735 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TGM1P22735 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGM1P22735 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGM1P22735 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGM1P22735 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGM1P22735 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGM1P22735 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGM1P22735 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGM1P22735 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGM1P22735 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TGM1P22735 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGM1P22735 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGM1P22735 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGM1P22735 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TGM1P22735 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGM1P22735 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGM1P22735 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGM1P22735 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGM1P22735 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGM1P22735 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGM1P22735 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGM1P22735 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGM1P22735 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGM1P22735 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TGM1P22735 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGM1P22735 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGM1P22735 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGM1P22735 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGM1P22735 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TGM1P22735 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGM1P22735 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TGM1P22735 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TGM1P22735 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TGM1P22735 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGM1P22735 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGM1P22735 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGM1P22735 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TGM1P22735 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGM1P22735 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGM1P22735 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGM1P22735 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGM1P22735 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGM1P22735 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGM1P22735 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGM1P22735 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGM1P22735 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TGM1P22735 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGM1P22735 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TGM1P22735 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGM1P22735 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGM1P22735 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGM1P22735 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGM1P22735 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGM1P22735 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms