Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMB1P20618 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMB1P20618 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB1P20618 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB1P20618 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB1P20618 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB1P20618 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB1P20618 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB1P20618 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMB1P20618 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMB1P20618 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB1P20618 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB1P20618 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB1P20618 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB1P20618 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB1P20618 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB1P20618 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB1P20618 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB1P20618 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB1P20618 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB1P20618 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMB1P20618 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms