Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
TRHP20396 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
TRHP20396 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.86■■■■■ 5.25
TRHP20396 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
TRHP20396 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
TRHP20396 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
TRHP20396 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
TRHP20396 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
TRHP20396 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
TRHP20396 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.62■■■■■ 5.21
TRHP20396 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
TRHP20396 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
TRHP20396 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
TRHP20396 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
TRHP20396 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
TRHP20396 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
TRHP20396 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.49■■■■■ 5.19
TRHP20396 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
TRHP20396 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
TRHP20396 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
TRHP20396 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
TRHP20396 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
TRHP20396 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
TRHP20396 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
TRHP20396 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
TRHP20396 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
TRHP20396 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
TRHP20396 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
TRHP20396 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
TRHP20396 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
TRHP20396 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
TRHP20396 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
TRHP20396 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
TRHP20396 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
TRHP20396 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
TRHP20396 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
TRHP20396 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
TRHP20396 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
TRHP20396 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
TRHP20396 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TRHP20396 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
TRHP20396 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
TRHP20396 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
TRHP20396 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
TRHP20396 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
TRHP20396 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
TRHP20396 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
TRHP20396 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
TRHP20396 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
TRHP20396 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
TRHP20396 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
TRHP20396 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
TRHP20396 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC46.78■■■■■ 5.08
TRHP20396 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
TRHP20396 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
TRHP20396 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
TRHP20396 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC46.63■■■■■ 5.06
TRHP20396 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
TRHP20396 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRHP20396 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
TRHP20396 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
TRHP20396 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
TRHP20396 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
TRHP20396 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
TRHP20396 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TRHP20396 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TRHP20396 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
TRHP20396 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
TRHP20396 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
TRHP20396 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
TRHP20396 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.44■■■■■ 5.02
TRHP20396 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
TRHP20396 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TRHP20396 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
TRHP20396 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
TRHP20396 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
TRHP20396 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
TRHP20396 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
TRHP20396 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
TRHP20396 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TRHP20396 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TRHP20396 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
TRHP20396 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
TRHP20396 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
TRHP20396 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
TRHP20396 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
TRHP20396 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
TRHP20396 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
TRHP20396 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
TRHP20396 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
TRHP20396 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRHP20396 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRHP20396 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRHP20396 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRHP20396 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
TRHP20396 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
TRHP20396 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
TRHP20396 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TRHP20396 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
TRHP20396 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms