Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA2P20248 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNA2P20248 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA2P20248 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCNA2P20248 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNA2P20248 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNA2P20248 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNA2P20248 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNA2P20248 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNA2P20248 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNA2P20248 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNA2P20248 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNA2P20248 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNA2P20248 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNA2P20248 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNA2P20248 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNA2P20248 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNA2P20248 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNA2P20248 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNA2P20248 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNA2P20248 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNA2P20248 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCNA2P20248 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNA2P20248 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNA2P20248 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNA2P20248 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNA2P20248 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNA2P20248 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA2P20248 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA2P20248 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNA2P20248 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNA2P20248 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNA2P20248 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNA2P20248 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNA2P20248 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNA2P20248 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms