Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF28P17035 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF28P17035 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF28P17035 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF28P17035 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF28P17035 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF28P17035 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF28P17035 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF28P17035 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF28P17035 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF28P17035 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF28P17035 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF28P17035 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF28P17035 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF28P17035 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF28P17035 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF28P17035 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF28P17035 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF28P17035 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF28P17035 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF28P17035 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF28P17035 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF28P17035 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF28P17035 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF28P17035 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF28P17035 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF28P17035 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF28P17035 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF28P17035 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF28P17035 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF28P17035 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF28P17035 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF28P17035 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF28P17035 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF28P17035 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF28P17035 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF28P17035 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF28P17035 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF28P17035 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF28P17035 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF28P17035 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF28P17035 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF28P17035 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF28P17035 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF28P17035 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF28P17035 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms