Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA2P15927 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA2P15927 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA2P15927 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA2P15927 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA2P15927 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA2P15927 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA2P15927 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA2P15927 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPA2P15927 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA2P15927 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA2P15927 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA2P15927 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA2P15927 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA2P15927 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPA2P15927 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA2P15927 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA2P15927 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA2P15927 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA2P15927 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA2P15927 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA2P15927 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPA2P15927 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA2P15927 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA2P15927 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA2P15927 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPA2P15927 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPA2P15927 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPA2P15927 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPA2P15927 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPA2P15927 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPA2P15927 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPA2P15927 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPA2P15927 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPA2P15927 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPA2P15927 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPA2P15927 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA2P15927 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA2P15927 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA2P15927 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA2P15927 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA2P15927 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA2P15927 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA2P15927 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA2P15927 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA2P15927 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA2P15927 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA2P15927 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA2P15927 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA2P15927 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA2P15927 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA2P15927 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA2P15927 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA2P15927 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA2P15927 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA2P15927 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA2P15927 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA2P15927 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA2P15927 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA2P15927 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA2P15927 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA2P15927 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA2P15927 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA2P15927 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA2P15927 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA2P15927 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA2P15927 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA2P15927 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA2P15927 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA2P15927 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA2P15927 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA2P15927 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA2P15927 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA2P15927 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA2P15927 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA2P15927 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA2P15927 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA2P15927 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA2P15927 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA2P15927 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA2P15927 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA2P15927 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA2P15927 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA2P15927 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA2P15927 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA2P15927 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA2P15927 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPA2P15927 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA2P15927 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA2P15927 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA2P15927 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA2P15927 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA2P15927 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPA2P15927 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA2P15927 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA2P15927 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA2P15927 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA2P15927 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA2P15927 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA2P15927 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms