Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRYGAP11844 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRYGAP11844 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRYGAP11844 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRYGAP11844 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRYGAP11844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRYGAP11844 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRYGAP11844 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRYGAP11844 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRYGAP11844 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRYGAP11844 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRYGAP11844 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRYGAP11844 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRYGAP11844 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRYGAP11844 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRYGAP11844 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRYGAP11844 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRYGAP11844 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRYGAP11844 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms