Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINGO3P0C6S8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINGO3P0C6S8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINGO3P0C6S8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LINGO3P0C6S8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINGO3P0C6S8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINGO3P0C6S8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINGO3P0C6S8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LINGO3P0C6S8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINGO3P0C6S8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINGO3P0C6S8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LINGO3P0C6S8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINGO3P0C6S8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINGO3P0C6S8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINGO3P0C6S8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINGO3P0C6S8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINGO3P0C6S8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINGO3P0C6S8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINGO3P0C6S8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINGO3P0C6S8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINGO3P0C6S8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINGO3P0C6S8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINGO3P0C6S8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINGO3P0C6S8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINGO3P0C6S8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINGO3P0C6S8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINGO3P0C6S8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO3P0C6S8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO3P0C6S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINGO3P0C6S8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms