Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TUBB4AP04350 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBB4AP04350 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBB4AP04350 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBB4AP04350 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TUBB4AP04350 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBB4AP04350 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TUBB4AP04350 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TUBB4AP04350 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBB4AP04350 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBB4AP04350 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TUBB4AP04350 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TUBB4AP04350 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TUBB4AP04350 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TUBB4AP04350 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBB4AP04350 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TUBB4AP04350 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TUBB4AP04350 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBB4AP04350 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TUBB4AP04350 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TUBB4AP04350 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBB4AP04350 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TUBB4AP04350 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBB4AP04350 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBB4AP04350 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TUBB4AP04350 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TUBB4AP04350 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TUBB4AP04350 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TUBB4AP04350 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBB4AP04350 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBB4AP04350 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBB4AP04350 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TUBB4AP04350 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
TUBB4AP04350 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TUBB4AP04350 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBB4AP04350 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBB4AP04350 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBB4AP04350 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUBB4AP04350 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBB4AP04350 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBB4AP04350 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUBB4AP04350 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUBB4AP04350 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TUBB4AP04350 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUBB4AP04350 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TUBB4AP04350 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUBB4AP04350 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TUBB4AP04350 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUBB4AP04350 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms