Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP3BO95985 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP3BO95985 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP3BO95985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP3BO95985 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP3BO95985 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP3BO95985 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP3BO95985 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP3BO95985 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP3BO95985 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP3BO95985 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP3BO95985 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP3BO95985 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP3BO95985 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOP3BO95985 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP3BO95985 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP3BO95985 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP3BO95985 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP3BO95985 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP3BO95985 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP3BO95985 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP3BO95985 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP3BO95985 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP3BO95985 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP3BO95985 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP3BO95985 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP3BO95985 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP3BO95985 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP3BO95985 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP3BO95985 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP3BO95985 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP3BO95985 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP3BO95985 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP3BO95985 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP3BO95985 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP3BO95985 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP3BO95985 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP3BO95985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP3BO95985 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP3BO95985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms