Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
UFL1O94874 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
UFL1O94874 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
UFL1O94874 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
UFL1O94874 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
UFL1O94874 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
UFL1O94874 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
UFL1O94874 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
UFL1O94874 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
UFL1O94874 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
UFL1O94874 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
UFL1O94874 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
UFL1O94874 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
UFL1O94874 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
UFL1O94874 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
UFL1O94874 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
UFL1O94874 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
UFL1O94874 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
UFL1O94874 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
UFL1O94874 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
UFL1O94874 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
UFL1O94874 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
UFL1O94874 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
UFL1O94874 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
UFL1O94874 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
UFL1O94874 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
UFL1O94874 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
UFL1O94874 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
UFL1O94874 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
UFL1O94874 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
UFL1O94874 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
UFL1O94874 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
UFL1O94874 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
UFL1O94874 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
UFL1O94874 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UFL1O94874 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UFL1O94874 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UFL1O94874 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UFL1O94874 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UFL1O94874 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
UFL1O94874 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
UFL1O94874 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
UFL1O94874 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
UFL1O94874 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
UFL1O94874 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
UFL1O94874 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
UFL1O94874 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
UFL1O94874 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
UFL1O94874 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
UFL1O94874 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
UFL1O94874 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
UFL1O94874 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
UFL1O94874 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
UFL1O94874 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
UFL1O94874 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
UFL1O94874 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
UFL1O94874 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
UFL1O94874 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
UFL1O94874 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
UFL1O94874 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
UFL1O94874 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
UFL1O94874 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
UFL1O94874 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
UFL1O94874 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
UFL1O94874 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
UFL1O94874 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
UFL1O94874 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
UFL1O94874 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
UFL1O94874 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
UFL1O94874 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
UFL1O94874 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
UFL1O94874 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UFL1O94874 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
UFL1O94874 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
UFL1O94874 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
UFL1O94874 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UFL1O94874 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UFL1O94874 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
UFL1O94874 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UFL1O94874 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
UFL1O94874 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
UFL1O94874 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
UFL1O94874 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
UFL1O94874 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
UFL1O94874 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
UFL1O94874 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
UFL1O94874 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
UFL1O94874 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
UFL1O94874 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
UFL1O94874 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
UFL1O94874 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
UFL1O94874 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
UFL1O94874 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
UFL1O94874 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
UFL1O94874 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
UFL1O94874 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
UFL1O94874 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
UFL1O94874 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UFL1O94874 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UFL1O94874 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms