Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX4O60224 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX4O60224 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX4O60224 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX4O60224 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSX4O60224 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX4O60224 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX4O60224 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX4O60224 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX4O60224 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX4O60224 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX4O60224 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX4O60224 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX4O60224 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSX4O60224 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX4O60224 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX4O60224 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX4O60224 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX4O60224 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX4O60224 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX4O60224 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSX4O60224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX4O60224 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX4O60224 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX4O60224 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX4O60224 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX4O60224 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX4O60224 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX4O60224 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX4O60224 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX4O60224 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX4O60224 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSX4O60224 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX4O60224 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX4O60224 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX4O60224 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX4O60224 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX4O60224 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX4O60224 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX4O60224 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX4O60224 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX4O60224 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX4O60224 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX4O60224 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX4O60224 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX4O60224 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX4O60224 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX4O60224 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSX4O60224 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX4O60224 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX4O60224 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX4O60224 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX4O60224 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX4O60224 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX4O60224 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX4O60224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX4O60224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX4O60224 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX4O60224 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX4O60224 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSX4O60224 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX4O60224 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX4O60224 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX4O60224 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSX4O60224 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSX4O60224 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSX4O60224 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSX4O60224 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSX4O60224 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX4O60224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSX4O60224 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX4O60224 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX4O60224 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSX4O60224 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSX4O60224 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSX4O60224 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX4O60224 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSX4O60224 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX4O60224 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX4O60224 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSX4O60224 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX4O60224 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSX4O60224 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSX4O60224 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX4O60224 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX4O60224 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX4O60224 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX4O60224 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX4O60224 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX4O60224 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX4O60224 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSX4O60224 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX4O60224 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX4O60224 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX4O60224 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms