Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TBX1O43435 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TBX1O43435 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBX1O43435 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBX1O43435 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBX1O43435 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBX1O43435 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBX1O43435 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TBX1O43435 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TBX1O43435 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TBX1O43435 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TBX1O43435 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TBX1O43435 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBX1O43435 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX1O43435 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBX1O43435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBX1O43435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX1O43435 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBX1O43435 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBX1O43435 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX1O43435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBX1O43435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX1O43435 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBX1O43435 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TBX1O43435 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TBX1O43435 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TBX1O43435 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TBX1O43435 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TBX1O43435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TBX1O43435 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TBX1O43435 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TBX1O43435 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TBX1O43435 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TBX1O43435 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TBX1O43435 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TBX1O43435 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX1O43435 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX1O43435 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX1O43435 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX1O43435 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX1O43435 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX1O43435 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX1O43435 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX1O43435 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX1O43435 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX1O43435 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX1O43435 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX1O43435 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX1O43435 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX1O43435 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX1O43435 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX1O43435 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBX1O43435 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX1O43435 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX1O43435 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX1O43435 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX1O43435 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX1O43435 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX1O43435 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX1O43435 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TBX1O43435 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX1O43435 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX1O43435 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX1O43435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX1O43435 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX1O43435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX1O43435 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX1O43435 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX1O43435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX1O43435 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX1O43435 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX1O43435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX1O43435 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX1O43435 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX1O43435 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX1O43435 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX1O43435 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX1O43435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX1O43435 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX1O43435 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX1O43435 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX1O43435 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX1O43435 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX1O43435 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX1O43435 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBX1O43435 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBX1O43435 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBX1O43435 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBX1O43435 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TBX1O43435 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX1O43435 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX1O43435 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX1O43435 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBX1O43435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBX1O43435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX1O43435 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TBX1O43435 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX1O43435 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX1O43435 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX1O43435 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms