Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEF1E1O43324 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EEF1E1O43324 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EEF1E1O43324 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EEF1E1O43324 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EEF1E1O43324 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EEF1E1O43324 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EEF1E1O43324 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEF1E1O43324 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEF1E1O43324 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEF1E1O43324 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEF1E1O43324 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EEF1E1O43324 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EEF1E1O43324 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EEF1E1O43324 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EEF1E1O43324 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EEF1E1O43324 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EEF1E1O43324 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEF1E1O43324 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEF1E1O43324 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1E1O43324 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEF1E1O43324 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEF1E1O43324 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EEF1E1O43324 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEF1E1O43324 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEF1E1O43324 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EEF1E1O43324 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1E1O43324 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1E1O43324 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEF1E1O43324 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EEF1E1O43324 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EEF1E1O43324 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 431.4 ms