Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUPL2O15504 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUPL2O15504 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUPL2O15504 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUPL2O15504 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUPL2O15504 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUPL2O15504 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUPL2O15504 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUPL2O15504 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUPL2O15504 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUPL2O15504 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUPL2O15504 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUPL2O15504 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUPL2O15504 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUPL2O15504 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUPL2O15504 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUPL2O15504 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUPL2O15504 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUPL2O15504 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUPL2O15504 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUPL2O15504 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUPL2O15504 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUPL2O15504 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms