Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC5O15440 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCC5O15440 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCC5O15440 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCC5O15440 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ABCC5O15440 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC5O15440 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC5O15440 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ABCC5O15440 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC5O15440 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC5O15440 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCC5O15440 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ABCC5O15440 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC5O15440 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCC5O15440 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC5O15440 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC5O15440 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC5O15440 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC5O15440 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC5O15440 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ABCC5O15440 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC5O15440 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC5O15440 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC5O15440 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC5O15440 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC5O15440 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ABCC5O15440 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ABCC5O15440 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ABCC5O15440 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
ABCC5O15440 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
ABCC5O15440 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
ABCC5O15440 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ABCC5O15440 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ABCC5O15440 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC5O15440 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC5O15440 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC5O15440 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC5O15440 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC5O15440 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC5O15440 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC5O15440 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC5O15440 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC5O15440 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCC5O15440 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCC5O15440 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCC5O15440 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCC5O15440 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCC5O15440 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC5O15440 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ABCC5O15440 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCC5O15440 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
ABCC5O15440 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC5O15440 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC5O15440 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC5O15440 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC5O15440 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCC5O15440 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCC5O15440 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC5O15440 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC5O15440 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCC5O15440 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCC5O15440 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCC5O15440 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC5O15440 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC5O15440 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC5O15440 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC5O15440 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC5O15440 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC5O15440 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC5O15440 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC5O15440 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC5O15440 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ABCC5O15440 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ABCC5O15440 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC5O15440 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC5O15440 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC5O15440 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ABCC5O15440 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC5O15440 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ABCC5O15440 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ABCC5O15440 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ABCC5O15440 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ABCC5O15440 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms