Protein–RNA interactions for Protein: O00425

IGF2BP3, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP3O00425 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.18□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 35.6
IGF2BP3O00425 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.167e-43■■■■■ 35.3
IGF2BP3O00425 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 35.1
IGF2BP3O00425 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.695e-7■■■■■ 35.1
IGF2BP3O00425 SELENOP-201ENST00000505309 573 ntTSL 214.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 34.6
IGF2BP3O00425 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 210.92□□□□□ -0.661e-9■■■■■ 34.4
IGF2BP3O00425 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 34.3
IGF2BP3O00425 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-213ENST00000528839 702 ntTSL 56□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-229ENST00000534272 591 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-230ENST00000534470 520 ntTSL 25.45□□□□□ -1.542e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-11■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 34.1
IGF2BP3O00425 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.238e-10■■■■■ 33.8
IGF2BP3O00425 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-68■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 GNG5-203ENST00000487806 557 ntTSL 37.76□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 33.6
IGF2BP3O00425 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 33.3
IGF2BP3O00425 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP3O00425 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 35.37□□□□□ -1.557e-11■■■■■ 32.6
IGF2BP3O00425 SELENOP-211ENST00000513303 714 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 32.4
IGF2BP3O00425 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 32.4
IGF2BP3O00425 TPT1-209ENST00000528619 731 ntTSL 28.91□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 36.28□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 HECTD1-214ENST00000556281 684 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.227e-8■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 328.78■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 227.94■■■□□ 2.065e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 527.65■■■□□ 2.025e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 322.85■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 219.87■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 32
IGF2BP3O00425 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 31.9
IGF2BP3O00425 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-10■■■■■ 31.9
IGF2BP3O00425 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 36.56□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 31.8
IGF2BP3O00425 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.267e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 55.98□□□□□ -1.457e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 24.92□□□□□ -1.627e-9■■■■■ 30.9
IGF2BP3O00425 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 217.93■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 39.88□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 SLC35F5-204ENST00000420066 736 ntTSL 35.9□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.623e-9■■■■■ 30.8
IGF2BP3O00425 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.316e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 323.04■■□□□ 1.286e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 223.04■■□□□ 1.286e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 521.16■□□□□ 0.986e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 321.03■□□□□ 0.966e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 320.7■□□□□ 0.96e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.166e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 213.94□□□□□ -0.186e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.266e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 513.34□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.526e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.936e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 58.08□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.88□□□□□ -1.316e-12■■■■■ 30.7
IGF2BP3O00425 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 511.99□□□□□ -0.495e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.835e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 29.22□□□□□ -0.935e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-204ENST00000465340 2240 ntTSL 213.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.377e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.617e-10■■■■■ 30.5
IGF2BP3O00425 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 3,649 protein–RNA pairs in 29.4 ms