Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL3

RNF212B, RING finger protein 212B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212BA8MTL3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF212BA8MTL3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF212BA8MTL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF212BA8MTL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF212BA8MTL3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF212BA8MTL3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF212BA8MTL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF212BA8MTL3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF212BA8MTL3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF212BA8MTL3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF212BA8MTL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF212BA8MTL3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF212BA8MTL3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF212BA8MTL3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF212BA8MTL3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF212BA8MTL3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF212BA8MTL3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF212BA8MTL3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF212BA8MTL3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF212BA8MTL3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF212BA8MTL3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF212BA8MTL3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF212BA8MTL3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF212BA8MTL3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF212BA8MTL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF212BA8MTL3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF212BA8MTL3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF212BA8MTL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF212BA8MTL3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF212BA8MTL3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms