Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD8B2A6NJW9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD8B2A6NJW9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD8B2A6NJW9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD8B2A6NJW9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD8B2A6NJW9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD8B2A6NJW9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD8B2A6NJW9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD8B2A6NJW9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD8B2A6NJW9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CD8B2A6NJW9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD8B2A6NJW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD8B2A6NJW9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CD8B2A6NJW9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD8B2A6NJW9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD8B2A6NJW9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD8B2A6NJW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD8B2A6NJW9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD8B2A6NJW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD8B2A6NJW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD8B2A6NJW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD8B2A6NJW9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD8B2A6NJW9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms