Protein–RNA interactions for Protein: A6NI15

MSGN1, Mesogenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSGN1A6NI15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSGN1A6NI15 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSGN1A6NI15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSGN1A6NI15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSGN1A6NI15 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSGN1A6NI15 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSGN1A6NI15 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSGN1A6NI15 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSGN1A6NI15 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSGN1A6NI15 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSGN1A6NI15 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSGN1A6NI15 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSGN1A6NI15 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSGN1A6NI15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSGN1A6NI15 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSGN1A6NI15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSGN1A6NI15 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSGN1A6NI15 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSGN1A6NI15 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSGN1A6NI15 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSGN1A6NI15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSGN1A6NI15 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSGN1A6NI15 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSGN1A6NI15 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSGN1A6NI15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MSGN1A6NI15 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSGN1A6NI15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSGN1A6NI15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSGN1A6NI15 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSGN1A6NI15 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSGN1A6NI15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSGN1A6NI15 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSGN1A6NI15 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms