Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPE3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1W2PPE3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1W2PPE3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A1W2PPE3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A1W2PPE3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A1W2PPE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1W2PPE3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1W2PPE3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1W2PPE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PPE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPE3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPE3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PPE3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PPE3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1W2PPE3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1W2PPE3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1W2PPE3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1W2PPE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1W2PPE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1W2PPE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PPE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPE3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms