Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPE3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PPE3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1W2PPE3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A1W2PPE3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1W2PPE3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1W2PPE3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A1W2PPE3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A1W2PPE3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PPE3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A1W2PPE3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1W2PPE3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A1W2PPE3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A1W2PPE3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A1W2PPE3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A1W2PPE3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A1W2PPE3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PPE3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PPE3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPE3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PPE3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2PPE3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2PPE3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PPE3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PPE3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PPE3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PPE3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PPE3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PPE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PPE3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PPE3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PPE3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PPE3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PPE3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPE3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPE3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPE3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPE3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PPE3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PPE3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PPE3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PPE3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PPE3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PPE3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PPE3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PPE3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PPE3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPE3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPE3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PPE3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPE3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPE3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A1W2PPE3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1W2PPE3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PPE3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPE3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPE3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPE3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPE3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPE3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPE3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPE3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A1W2PPE3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PPE3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPE3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPE3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PPE3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPE3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPE3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPE3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A1W2PPE3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PPE3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms