Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J238

TRAV1-2, T-cell receptor alpha variable 1-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-2A0A0B4J238 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAV1-2A0A0B4J238 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAV1-2A0A0B4J238 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAV1-2A0A0B4J238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAV1-2A0A0B4J238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAV1-2A0A0B4J238 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAV1-2A0A0B4J238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAV1-2A0A0B4J238 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAV1-2A0A0B4J238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAV1-2A0A0B4J238 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAV1-2A0A0B4J238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAV1-2A0A0B4J238 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAV1-2A0A0B4J238 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAV1-2A0A0B4J238 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAV1-2A0A0B4J238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAV1-2A0A0B4J238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV1-2A0A0B4J238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAV1-2A0A0B4J238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAV1-2A0A0B4J238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV1-2A0A0B4J238 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAV1-2A0A0B4J238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAV1-2A0A0B4J238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAV1-2A0A0B4J238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAV1-2A0A0B4J238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAV1-2A0A0B4J238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAV1-2A0A0B4J238 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAV1-2A0A0B4J238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAV1-2A0A0B4J238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAV1-2A0A0B4J238 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAV1-2A0A0B4J238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAV1-2A0A0B4J238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV1-2A0A0B4J238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV1-2A0A0B4J238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAV1-2A0A0B4J238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAV1-2A0A0B4J238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAV1-2A0A0B4J238 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAV1-2A0A0B4J238 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAV1-2A0A0B4J238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAV1-2A0A0B4J238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAV1-2A0A0B4J238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAV1-2A0A0B4J238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAV1-2A0A0B4J238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAV1-2A0A0B4J238 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV1-2A0A0B4J238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAV1-2A0A0B4J238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms