Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms