Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GDE1Q9NZC3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDE1Q9NZC3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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