Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TMCO5AQ8N6Q1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TMCO5AQ8N6Q1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TMCO5AQ8N6Q1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMCO5AQ8N6Q1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TMCO5AQ8N6Q1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMCO5AQ8N6Q1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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