Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC96Q2M329 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CCDC96Q2M329 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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