Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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