Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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