Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms