Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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GTF2H2Q13888 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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