Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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