Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX11P35716 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX11P35716 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX11P35716 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms