Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VGLL3A8MV65 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VGLL3A8MV65 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms