Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UPK3BQ9BT76 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms