Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBXN4Q92575 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms