Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT80Q6KB66 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms