Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A4Q6AI14 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms