Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERFP50548 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERFP50548 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms