Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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