Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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RABGGTAQ92696 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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