Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMEM225Q6GV28 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMEM225Q6GV28 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms