Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB4BP68371 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms