Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2E2P29084 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2E2P29084 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms