Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK4P11802 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK4P11802 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms