Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCN2BO60939 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCN2BO60939 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCN2BO60939 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCN2BO60939 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN2BO60939 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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